Omero Integration 高级用法

# 高级功能 本参考文档涵盖高级 OMERO 操作，包括权限、删除、文件集和管理任务。 ## 删除对象 ### 等待删除 python # 删除对象并等待完成 project_ids = [1, 2, 3] conn.deleteObjects("Project", project_ids, wait=True) print("Deletion complete") # 不等待删除 (异步) conn.deleteObjects("Dataset", [dataset_id], wait=False) ### 使用回调监控删除 python from omero.callbacks import CmdCallbackI # 开始删除操作 handle = conn.deleteObjects("Project", [project_id]) # 创建回调以监控进度 cb = CmdCallbackI(conn.c, handle) print("Deleting, please wait...") # 轮询完成情况 while not cb.block(500): # 每 500ms 检查一次 print(".", end="", flush=True) print("nDeletion finished") # 检查错误 response = cb.getResponse() if isinstance(response, omero.cmd.ERR): print("Error occurred:") print(response) else: print("Deletion successful") # 清理 cb.close(True) # 同时关闭句柄 ### 删除不同类型的对象 python # 删除图像 image_ids = [101, 102, 103] conn.deleteObjects("Image", image_ids, wait=True) # 删除数据集 dataset_ids = [10, 11] conn.deleteObjects("Dataset", dataset_ids, wait=True) # 删除 ROI roi_ids = [201, 202] conn.deleteObjects("Roi", roi_ids, wait=True) # 删除注释 annotation_ids = [301, 302] conn.deleteObjects("Annotation", annotation_ids, wait=True) ### 级联删除 python # 删除项目将级联到包含的数据集 # 此行为取决于服务器配置 project_id = 123 conn.deleteObjects("Project", [project_id], wait=True) # 数据集和图像可能会被删除或成为孤立对象 # 取决于删除规范 ## 文件集 (Filesets) 文件集代表原始导入文件的集合。它们是在 OMERO 5.0 中引入的。 ### 检查图像是否有文件集 python image = conn.getObject("Image", image_id) fileset = image.getFileset() if fileset: print(f"Image is part of fileset {fileset.getId()}") else: print("Image has no fileset (pre-OMERO 5.0)") ### 访问文件集信息 python image = conn.getObject("Image", image_id) fileset = image.getFileset() if fileset: fs_id = fileset.getId() print(f"Fileset ID: {fs_id}") # 列出此文件集中的所有图像 print("Images in fileset:") for fs_image in fileset.copyImages(): print(f" {fs_image.getId(")