Brenda Database API 参考

# BRENDA 数据库 API 参考 ## 概述 本文档提供了 BRENDA (布伦瑞克酶数据库) SOAP API 和 Python 客户端实现的详细参考信息。BRENDA 是世界上最全面的酶信息系统，包含超过 45,000 种酶和数百万个动力学数据点。 ## SOAP API 端点 ### 基础 WSDL URL https://www.brenda-enzymes.org/soap/brenda_zeep.wsdl ### 身份验证 所有 BRENDA API 调用都需要使用电子邮件和密码进行身份验证： **参数：** - `email`: 您注册的 BRENDA 电子邮件地址 - `password`: 您的 BRENDA 账户密码 **身份验证过程：** 1. 密码在传输前使用 SHA-256 进行哈希处理 2. 电子邮件和哈希后的密码作为每个 API 调用中的前两个参数包含在内 3. 对 `BRENDA_EMIAL` 环境变量的遗留支持 (注意拼写错误) ## 可用的 SOAP 操作 ### getKmValue 检索酶的米氏常数 (Km) 值。 **参数：** 1. `email`: BRENDA 账户电子邮件 2. `passwordHash`: SHA-256 哈希密码 3. `ecNumber*: 酶的 EC 编号 (允许使用通配符) 4. `organism*: 生物体名称 (允许使用通配符，默认: "*") 5. `kmValue*: Km 值字段 (默认: "*") 6. `kmValueMaximum*: 最大 Km 值字段 (默认: "*") 7. `substrate*: 底物名称 (允许使用通配符，默认: "*") 8. `commentary*: 注释字段 (默认: "*") 9. `ligandStructureId*: 配体结构 ID 字段 (默认: "*") 10. `literature*: 文献参考字段 (默认: "*") **通配符：** - `*`: 匹配任何序列 - 可与部分 EC 编号一起使用 (例如 "1.1.*") **响应格式：** organism*Escherichia coli#substrate*glucose#kmValue*0.12#kmValueMaximum*#commentary*pH 7.4, 25°C#ligandStructureId*#literature* **示例响应字段：** - `organism`: 源生物体 - `substrate`: 底物名称 - `kmValue`: 米氏常数值 (通常以 mM 为单位) - `kmValueMaximum`: 最大 Km 值 (如果可用) - `commentary`: 实验条件 (pH, 温度等) - `ligandStructureId`: BRENDA 配体结构标识符 - `literature`: 主要文献参考 ### getReaction 检索酶的反应方程和化学计量。 **参数：** 1. `email`: BRENDA 账户电子邮件 2. `passwordHash`: SHA-256 哈希密码 3. `ecNumber*: 酶的 EC 编号 (允许使用通配符) 4. `organism*: 生物体名称 (允许使用通配符，默认: "*") 5. `reaction*: 反应方程 (允许使用通配符