biorxiv-database

# bioRxiv 数据库 ## 概述 此技能提供了基于 Python 的高效工具，用于搜索和检索 bioRxiv 数据库中的预印本。它支持通过关键词、作者、日期范围和类别进行全面搜索，并返回包含标题、摘要、DOI 和引用信息的结构化 JSON 元数据。该技能还支持下载 PDF 以进行全文分析。 ## 何时使用此技能 在以下情况使用此技能： - 搜索特定研究领域的最新预印本 - 追踪特定作者的出版物 - 进行系统性文献综述 - 分析一段时间内的研究趋势 - 检索用于引文管理的元数据 - 下载预印本 PDF 进行分析 - 按 bioRxiv 主题类别过滤论文 ## 核心搜索功能 ### 1. 关键词搜索 搜索标题、摘要或作者列表中包含特定关键词的预印本。 **基本用法：** python python scripts/biorxiv_search.py --keywords "CRISPR" "gene editing" --start-date 2024-01-01 --end-date 2024-12-31 --output results.json **带类别过滤：** python python scripts/biorxiv_search.py --keywords "neural networks" "deep learning" --days-back 180 --category neuroscience --output recent_neuroscience.json **搜索字段：** 默认情况下，关键词会在标题和摘要中搜索。使用 `--search-fields` 进行自定义： python python scripts/biorxiv_search.py --keywords "AlphaFold" --search-fields title --days-back 365 ### 2. 作者搜索 查找特定作者在日期范围内的所有论文。 **基本用法：** python python scripts/biorxiv_search.py --author "Smith" --start-date 2023-01-01 --end-date 2024-12-31 --output smith_papers.json **近期出版物：** python # 如果未指定日期，默认为过去一年 python scripts/biorxiv_search.py --author "Johnson" --output johnson_recent.json ### 3. 日期范围搜索 检索在特定日期范围内发布的所有预印本。 **基本用法：** python python scripts/biorxiv_search.py --start-date 2024-01-01 --end-date 2024-01-31 --output january_2024.json **带类别过滤：** python python scripts/biorxiv_search.py --start-date 2024-06-01 --end-date 2024-06-30 --category genomics --output genomics_june.json **天数快捷方式：** python # 最近 30 天 python scripts/biorxiv_search.py --days-back 30 -