数据访问与检索

# 数据访问与检索 本参考指南涵盖了导航 OMERO 的层级数据结构以及检索对象的相关内容。 ## OMERO 数据层级 ### 标准层级 Project (项目) └─ Dataset (数据集) └─ Image (图像) ### 筛选层级 Screen (筛选) └─ Plate (板) └─ Well (孔) └─ WellSample (孔样本) └─ Image (图像) ## 列出对象 ### 列出项目 python # 列出当前用户的所有项目 for project in conn.listProjects(): print(f"项目: {project.getName()} (ID: {project.getId()})") ### 带过滤条件列出项目 python # 获取当前用户和组 my_exp_id = conn.getUser().getId() default_group_id = conn.getEventContext().groupId # 带过滤器列出项目 for project in conn.getObjects("Project", opts={ 'owner': my_exp_id, # 按所有者过滤 'group': default_group_id, # 按组过滤 'order_by': 'lower(obj.name)', # 按字母顺序排序 'limit': 10, # 结果限制 'offset': 0 # 分页偏移量 }): print(f"项目: {project.getName()}") ### 列出数据集 python # 列出所有数据集 for dataset in conn.getObjects("Dataset"): print(f"数据集: {dataset.getName()} (ID: {dataset.getId()})") # 列出孤立数据集（不属于任何项目） for dataset in conn.getObjects("Dataset", opts={'orphaned': True}): print(f"孤立数据集: {dataset.getName()}") ### 列出图像 python # 列出所有图像 for image in conn.getObjects("Image"): print(f"图像: {image.getName()} (ID: {image.getId()})") # 列出特定数据集中的图像 dataset_id = 123 for image in conn.getObjects("Image", opts={'dataset': dataset_id}): print(f"图像: {image.getName()}") # 列出孤立图像 for image in conn.getObjects("Image", opts={'orphaned': True}): print(f"孤立图像: {image.getName()}") ## 按 ID 检索对象 ### 获取单个对象 python # 按 ID 获取项目 project = conn.getObject("Project", project_id) if project: print(f"项目: {project.getName()}") else: print("未找到项目") # 按 ID 获取数据集 dataset = conn.getObject("Dataset", dataset_id) # 按 ID 获取图像 image = conn.getObject("Image", image_id) ### 按 ID 获取多个对象 python # 一次获取多个项目 project_ids = [1, 2, 3, 4, 5] projects = conn.getObjects("Project", project_ids) for project in projects: print(f"项目: {project.getName()}") ### 支持