filtering

# Matchms 过滤函数参考 本文档提供了 matchms 中用于处理质谱数据的所有过滤函数的全面参考。 ## 元数据处理过滤器 ### 化合物与化学信息 **add_compound_name(spectrum)** - 将化合物名称添加到正确的元数据字段 - 标准化化合物名称的存储位置 **clean_compound_name(spectrum)** - 移除化合物名称中常见的冗余添加项 - 清理格式不一致的问题 **derive_adduct_from_name(spectrum)** - 从化合物名称中提取加合物信息 - 将加合物标记移动到正确的元数据字段 **derive_formula_from_name(spectrum)** - 检测化合物名称中的化学式 - 将化学式重定位到适当的元数据字段 **derive_annotation_from_compound_name(spectrum)** - 使用化合物名称从 PubChem 检索 SMILES/InChI - 自动注释化学结构 ### 化学结构转换 **derive_inchi_from_smiles(spectrum)** - 从 SMILES 字符串生成 InChI - 需要 rdkit 库 **derive_inchikey_from_inchi(spectrum)** - 从 InChI 计算 InChIKey - 27 字符的哈希标识符 **derive_smiles_from_inchi(spectrum)** - 从 InChI 表示创建 SMILES - 需要 rdkit 库 **repair_inchi_inchikey_smiles(spectrum)** - 校正错位的化学标识符 - 修复元数据字段混淆 **repair_not_matching_annotation(spectrum)** - 确保 SMILES、InChI 和 InChIKey 之间的一致性 - 验证化学结构注释是否匹配 **add_fingerprint(spectrum, fingerprint_type="daylight", nbits=2048, radius=2)** - 生成用于相似度计算的分子指纹 - 指纹类型: "daylight", "morgan1", "morgan2", "morgan3" - 与 FingerprintSimilarity 评分配合使用 ### 质量与电荷信息 **add_precursor_mz(spectrum)** - 归一化前体 m/z 值 - 标准化前体质量元数据 **add_parent_mass(spectrum, estimate_from_adduct=True)** - 从前体 m/z 和加合物计算中性母体质量 - 如果无法直接获取，可根据加合物进行估算 **correct_charge(spectrum)** - 将电荷值与离子模式对齐 - 确保电荷符号与电离模式匹配 **make_charge_int(spectrum)** - 将电荷转换为整数格式 - 标准化电荷表示 **clean_adduct(spectrum)** - 标准化加合物标记 - 校正常见的加合物格式问题 **interpret_pepmass(spectrum)** - 解析 pepmass