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# Medchem 规则与过滤器目录 Medchem 中所有可用药物化学规则、结构警示和过滤器的综合目录。 ## 目录 1. [药物相似性规则](#drug-likeness-rules) 2. [类先导规则](#lead-likeness-rules) 3. [片段规则](#fragment-rules) 4. [CNS 规则](#cns-rules) 5. [结构警示过滤器](#structural-alert-filters) 6. [化学基团模式](#chemical-group-patterns) --- ## 药物相似性规则 ### 五规则 (Lipinski) **参考：** Lipinski et al., Adv Drug Deliv Rev (1997) 23:3-25 **目的：** 预测口服生物利用度 **标准：** - 分子量 ≤ 500 Da - LogP ≤ 5 - 氢键供体 ≤ 5 - 氢键受体 ≤ 10 **用法：** python mc.rules.basic_rules.rule_of_five(mol) **备注：** - 药物研发中最广泛使用的过滤器之一 - 约 90% 的口服活性药物符合这些规则 - 存在例外情况，特别是天然产物和抗生素 --- ### Veber 规则 **参考：** Veber et al., J Med Chem (2002) 45:2615-2623 **目的：** 口服生物利用度的附加标准 **标准：** - 可旋转键 ≤ 10 - 拓扑极性表面积 (TPSA) ≤ 140 Ų **用法：** python mc.rules.basic_rules.rule_of_veber(mol) **备注：** - 补充五规则 - TPSA 与细胞渗透性相关 - 可旋转键影响分子柔性 --- ### 药物规则 **目的：** 综合药物相似性评估 **标准：** - 通过五规则 - 通过 Veber 规则 - 不包含 PAINS 子结构 **用法：** python mc.rules.basic_rules.rule_of_drug(mol) --- ### REOS (Rapid Elimination Of Swill) **参考：** Walters & Murcko, Adv Drug Deliv Rev (2002) 54:255-271 **目的：** 过滤掉不太可能成为药物的化合物 **标准：** - 分子量: 200-500 Da - LogP: -5 到 5 - 氢键供体: 0-5 - 氢键受体: 0-10 **用法：** python mc.rules.basic_rules.rule_of_reos(mol) --- ### 黄金三角 **参考：** Johnson et al., J Med Chem (2009) 52:5487-5500 **目的：** 平衡亲脂性和分子量 **标准：** - 200 ≤ MW ≤ 50 × LogP + 400 - LogP: -2 到 5 **用法：** python mc.rules.basic_rules.golden_triangle(mol) **备注：** - 定义了最佳物理化学空间 - 在 MW 与 LogP 图上视觉表现类似于三角形 --- ## 类先导规则 ### Oprea 规则 **参考：** Oprea et al., J Chem Inf Comput Sci (2001) 41:1308-13