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# 靶点注释与特征 ## 概述 Open Targets 将靶点定义为“任何可被药物产品靶向的天然分子”。靶点主要是由 Ensembl 基因 ID 标识的蛋白质编码基因，但也包括来自典型染色体的 RNA 和假基因。 ## 核心靶点注释 ### 1. 成药性评估 (Tractability Assessment) 成药性评估靶点在不同模式下的药物开发潜力。 #### 评估模式： **小分子** - 小分子成药性预测 - 基于结构特征、化学先例 - 分类：临床先例、发现先例、预测可成药 **抗体** - 基于抗体的治疗成功可能性 - 细胞表面/分泌蛋白定位 - 先例类别与小分子相似 **PROTAC (蛋白质降解)** - 靶向蛋白质降解评估 - E3 连接酶兼容性 - 新兴模式类别 **其他模式** - 基因治疗、基于 RNA 的疗法 - 寡核苷酸方法 #### 成药性水平： 1. **临床先例** - 具有相似机制的已批准/临床药物的靶点 2. **发现先例** - 工具化合物或处于临床前开发阶段化合物的靶点 3. **预测可成药** - 计算预测表明具有成药性 4. **未知** - 数据不足以评估 ### 2. 安全性风险 (Safety Liabilities) 从多个来源汇总安全性信息，以识别潜在的毒性问题。 #### 数据源： **ToxCast** - 高通量毒理学筛选数据 - 体外实验结果 - 毒性通路激活 **AOPWiki (不良结局通路)** - 从分子起始事件到不良结局的机制通路 - 系统毒理学框架 **PharmGKB** - 药物基因组学关系 - 影响药物反应和毒性的遗传变异 **已发表文献** - 从出版物中整理的专家安全性关注点 - 临床试验不良事件 #### 安全性标记： - **器官毒性** - 肝脏、肾脏、心脏影响 - **靶点安全性风险** - 已知的靶点相关毒性效应 - **脱靶效应** - 非预期活性关注 - **临床观察** - 针对该基因的药物产生的不良事件 ### 3. 基线表达 来自多个来源的跨组织和细胞类型的基因/蛋白质表达。 #### 数据源： **Expression Atlas** - 跨组织/条件的 RNA-Seq 表达 - 标准化表达水平 (TPM, FPKM) - 差异