[ PROMPT_NODE_26530 ]
targets-pathways
[ SKILL_DOCUMENTATION ]
# 药物靶点与通路
## 概述
DrugBank 提供关于药物-蛋白质相互作用的全面信息,包括靶点、酶、转运体和载体。这些数据对于理解药物机制、识别药物重定位机会以及预测脱靶效应至关重要。
## 蛋白质相互作用类别
### 靶点蛋白
药物结合产生治疗效果的主要蛋白质:
- **受体**: G 蛋白偶联受体、核受体、离子通道
- **酶**: 激酶、蛋白酶、磷酸酶
- **转运体**: 用作靶点(不仅用于 ADME)
- **其他**: 结构蛋白、DNA/RNA
### 代谢酶
参与药物代谢的酶:
- **细胞色素 P450 酶**: CYP3A4, CYP2D6, CYP2C9 等
- **II 相酶**: UGTs, SULTs, GSTs
- **酯酶和肽酶**
### 转运体
参与药物跨膜转运的蛋白质:
- **摄取转运体**: OATPs, OCTs
- **外排转运体**: P-糖蛋白, BCRP, MRPs
- **其他**: SLC 和 ABC 转运体家族
### 载体
结合并运输药物的血浆蛋白:
- **白蛋白**: 血液中主要的药物载体
- **α-1-酸性糖蛋白**
- **脂蛋白**
- **特异性结合蛋白**: SHBG, CBG 等
## XML 数据结构
### 靶点元素结构
xml
BE0000001
Prothrombin
Humans
inhibitor
yes
Prothrombin
丝氨酸型内肽酶活性
凝血酶在...中起作用
F2
Homo sapiens
UniProtKB
P00734
MAHVRGLQLP...
...
...
## 提取靶点信息
### 获取药物靶点
python
from drugbank_downloader import get_drugbank_root
def get_drug_targets(drugbank_id):
"""提取药物的所有靶点"""
root = get_drugbank_root()
ns = {'db': 'http://www.drugbank.ca'}
for drug in root.findall('